PROJECT

Research on Nanopore Sequencing as State Defense Against Biological Threats – NANOiDEF

Contract No: SEMOD-EL76/99-11/2025
Recipient: MicroPoll s.r.o., Vazovova 5, 812 43 Bratislava 1
Project duration: 09/2025 – 08/2027 (24 mesiacov)
Grant amount: 193 473,28 €

The NANOiDEF project researches and develops a portable system for rapid identification of biological threats directly in the field. Using third-generation nanopore sequencing (Oxford Nanopore MinION), portable computing devices, and artificial intelligence algorithms (AI/ML), the system reduces analysis time from days to 1–3 hours after sample collection. The research covers in-field optimization of nucleic-acid isolation (e.g., using PowerFecal-type kits), the design of a bioinformatic pipeline, and the integration of hardware and software into a functional all-in-one prototype.

Project results will be applicable in defense against biological weapons, military and peacekeeping operations, crisis management, identification of epidemic outbreaks, and complementary medical diagnostics, including the detection of genetically modified organisms.

The project is financially supported by the Ministry of Defense of the Slovak Republic.

Výskum využitia nanopórového sekvenovania ako obrany štátu pred biologickými hrozbami – NANOiDEF

Číslo zmluvy: SEMOD-EL76/99-11/2025
Prijímateľ: MicroPoll s.r.o., Vazovova 5, 812 43 Bratislava 1
Trvanie projektu: 09/2025 – 08/2027 (24 mesiacov)
Výška dotácie: 193 473,28 €

Cieľom projektu NANOiDEF je výskum a vývoj prenosného systému na rýchlu identifikáciu biologických hrozieb priamo v teréne. Pomocou nanopórového sekvenovania tretej generácie (Oxford Nanopore MinION), prenosných výpočtových zariadení a algoritmov umelej inteligencie (AI/ML) skráti systém čas analýzy zo dní na 1–3 hodiny od odberu vzorky. Výskum zahŕňa optimalizáciu izolácie nukleových kyselín priamo v teréne (napr. pomocou kitov typu PowerFecal), návrh bioinformatickej pipeline a integráciu hardvéru a softvéru do funkčného all-in-one prototypu.

Výsledky projektu budú využiteľné pri obrane proti biologickým zbraniam, vo vojenských a mierových operáciách, pri krízovom manažmente a identifikácii epidemických ohnísk, ako aj v doplnkovej medicínskej diagnostike vrátane detekcie geneticky modifikovaných organizmov.